但是，倪家营子血战使西路军伤亡惨重，由于缺粮缺水，有耗无补，西路军被迫转移到祁连山深处的石窝山上，这时所剩人员已不足3000 人，基本上败局已定了。
党中央、中央军委时刻关注着战局的变化。为解除西路军之围，中共中央决定组成以刘伯承为司令员的援西军，前去援助和接应西路军。刘伯承率领援西军刚刚出发抵达甘肃东部的镇原，便收到中央发来的电报，说西路军经过多次浴血奋战，屡遭挫折，伤亡很大，最后到了祁连山，已经处于弹尽粮绝的境地。西路军到了这种地步，而援西军还在甘肃东部，即使渡河过去，也实在是远水解不了近渴，无法援救西路军兵败祁连了。
3 月14 日黄昏，在石窝山的一处密林中，陈昌浩主持召开西路军军政委员会，会议决定，将剩下的兵力和人员分三路开展游击活动，并将此决定上报中央。3 月17 日，中央军委复电李先念等，同意以主动的游击战争，独立争取自己的生存和发展。无奈之下，李先念率红30 军主力5 个营和总部直属队人员共1500 余人，前往西面大山打游击。分手之际，李先念怀着依依惜别的心情，送别徐向前、陈昌浩等，然后立即集合部队开始转移，从此踏上了40 多个日日夜夜的险恶征程……西路军是一支非常优秀的部队。鄂豫皖的黄麻起义、商南起义、六霍起义的老底子在里面，还有川东游击军、宁都暴动的老底子，这是一支意志旺盛、作风顽强、英勇善战、战功卓著的战斗队伍，它的失利实在太可惜了，是中国工农红军的重大损失，是中国革命的重大损失。